최근 항생제 오남용으로 인한 축산물내 잔류와 항생제 내성세균의 발현 문제가 국가적인 이슈로 급부상하고 있으며 많은 소비자들이 식품안전성과 관련하여 심각한 우려를 나타내고 있다. 배합사료에 첨가하여 사용하는 항생제는 가축의 성장촉진 및 사료효율개선 목적으로 사용되고 있으며 가축의 건강 유지와 축산물의 생산성 향상에 크게 기여해왔다. 최근 유럽을 중심으로 항생제 내성 감소를 위한 조치의 일환으로 배합사료에 첨가하는 항생제의 사용을 전면 중지하기에 이르렀다. 우리나라도 사료에 혼합가능한 항생제 등 동물용의약품을 53종에서 25종으로 감축한바 있으며, 사료공장에도 HACCP제도(위해요소중점관리)를 도입하여 배합사료에 항생제의 교차오염이 일어나지 않도록 철저히 관리해나가고 있다. 본고에서는 배합사료공장과 농장에서의 항생제 교차오염 방지를 위한 관리방법과 농장에서의 올바른 항생제의 사용을 위한 내용을 기술하였다.