바이오안전성위원회의 위원장은 국무총리이고 아래로 국가책임기관과 국가연락기관이 있다. 국가책임기관은 지식경제부, 국가연락기관은 외교통상부이다. BCH 국가연락기관은 바이오안전성정보센터이다. 아래로 교과부, 농식품부, 지식경제부, 보건복지부, 환경부, 국토부가 있다. 교과부는 시험연구용 LMO, 농식품부는 농업, 임업, 축산업, 수산용 LMO, 지식경제부는 산업용 LMO, 보건복지부는 보건의료용 LMO, 환경부는 환경정화용 LMO, 국토부는 해양수산용 LMO에 관한 업무를 관장한다.